La religione principale in Uzbekistan è l'Islam, ma è uno stato laico, dove i rappresentanti di diverse religioni e confessioni convivono in armonia. Secondo i dati ufficiali, oggi sono registrate 2225 organizzazioni religiose, di 16 diverse confessioni religiose. Questa variegata immagine etnica dell'Uzbekistan afferma che esiste un'elevata tolleranza nei confronti della questione religiosa nel paese. La Costituzione dell'Uzbekistan protegge la libertà religiosa. Ognuno ha il diritto di professare o non professare alcuna religione. (Art.31)
L'Islam sunnita è la religione dominante in Uzbekistan e costituisce il 93% della popolazione del paese, ad eccezione dell'1% dei musulmani sciiti che vivono principalmente nel territorio di Bukhara e Samarcanda.
Il cristianesimo è l'altra religione con la maggior parte dei seguaci che ha entrambi i suoi flussi: ortodosso (4%) e cattolicesimo (%3).
Nel 2011, la Chiesa ortodossa russa ha celebrato il suo 140° anniversario in Asia centrale che ha avuto luogo in Uzbekistan. Il cristianesimo ortodosso aveva raggiunto queste terre nel 1871 dopo l'annessione all'Impero russo per ordine dell'imperatore russo Alessandro II che dichiarava la decisione del Santo Sinodo riguardo alla creazione di un'eparchia indipendente di Tashkent e del Turkestan. Nello stesso anno fu fondata una chiesa vicino all'ospedale di Tashkent. Oggi si è trasformata in una bellissima cattedrale della Santa Dormizione, la chiesa principale dell'eparchia di Tashkent. La maggior parte dei credenti visita questo luogo santo, sebbene ci siano poche altre chiese a Tashkent (ad esempio, la chiesa di Alexander Nevskiy al cimitero di Botkin, la chiesa del Patriarca Ermogen, la chiesa del Gran Principe Vladimir). Ci sono anche molte chiese antiche in altre città dell'Uzbekistan. A Samarcanda c'è una Cattedrale di Sant'Alessio, a Kokand c'è la Chiesa dell'icona di Kazan della Madre di Dio e altre.
A Tashkent è stato aperto anche un convento del St. Nikolay, che è il primo in Asia centrale, e il seminario teologico di Tashkent.
Secondo le statistiche c'erano 38 chiese ortodosse e più di 600mila cristiani ortodossi nella prima metà del 2014 in Uzbekistan.
La confessione cattolica in Uzbekistan non è così numerosa, anche se la Chiesa cattolica (Kostel) del Sacro Cuore di Gesù Cristo è attiva da quasi un secolo ed è una delle principali attrazioni della capitale.
Le chiese di altre confessioni significative includono la Chiesa apostolica armena e le sinagoghe ebraiche. Parlando delle sinagoghe, vale la pena notare gli ebrei di Bukhara, un gruppo di ebrei che vivono nel territorio dell'Asia centrale, principalmente a Bukhara. Ecco da dove viene il nome. La comunità ebraica di Bukhara è stata menzionata negli scritti del XIII secolo. Vivevano in quartieri separati e si dedicavano alla tessitura, alla tintura e al piccolo commercio. Successivamente gli ebrei di Bukhara iniziarono a stabilirsi come diaspore a Samarcanda, Kokand e Andijan. Negli ultimi secoli sono riusciti a preservare la loro lingua, fede e tradizioni.